Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Acta1P68134 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms