Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp25P57080 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp25P57080 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp25P57080 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Usp25P57080 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Usp25P57080 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Usp25P57080 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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