Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CckbrP56481 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CckbrP56481 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CckbrP56481 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CckbrP56481 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CckbrP56481 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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