Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rad23bP54728 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tsc22d3-204ENSMUST00000123898 952 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rad23bP54728 AC159282.1-204ENSMUST00000219472 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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