Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lbx1P52955 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lbx1P52955 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lbx1P52955 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lbx1P52955 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lbx1P52955 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Lbx1P52955 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lbx1P52955 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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