Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RorcP51450 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
RorcP51450 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms