Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmod1P49813 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms