Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Epb41P48193 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Epb41P48193 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Epb41P48193 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Epb41P48193 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Epb41P48193 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms