Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Egr3P43300 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Egr3P43300 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Egr3P43300 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Egr3P43300 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms