Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tnfsf9P41274 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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