Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
LtbP41155 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
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