Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ThpoP40226 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
ThpoP40226 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms