Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ccna1-204ENSMUST00000198320 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprkP35822 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprkP35822 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms