Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hoxc5P32043 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Hoxc5P32043 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms