Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 5730422E09Rik-201ENSMUST00000180733 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm17225-201ENSMUST00000172051 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm20483-201ENSMUST00000173162 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5278-201ENSMUST00000055957 552 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm3137-201ENSMUST00000218177 620 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PtprmP28828 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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