Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NapbP28663 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NapbP28663 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NapbP28663 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms