Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb9P28076 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms