Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Pde6aP27664 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Pde6aP27664 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pde6aP27664 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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