Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
PdgfraP26618 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms