Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Hoxd12P23812 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms