Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
RarbP22605 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
RarbP22605 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RarbP22605 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
RarbP22605 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
RarbP22605 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
RarbP22605 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RarbP22605 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms