Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fcer1aP20489 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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