Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm5860-202ENSMUST00000151038 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Hoxb1P17919 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms