Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Osgep-207ENSMUST00000162177 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Sptan1P16546 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20831-201ENSMUST00000177639 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Ssty1-202ENSMUST00000186035 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20737-202ENSMUST00000187245 1338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20777-202ENSMUST00000187434 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20873-202ENSMUST00000187857 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20772-201ENSMUST00000188928 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm21310-202ENSMUST00000189630 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20795-202ENSMUST00000190909 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Sptan1P16546 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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