Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gabra6P16305 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabra6P16305 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms