Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RhoP15409 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RhoP15409 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RhoP15409 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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