Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Vpreb2P13373 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms