Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SparcP07214 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SparcP07214 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
SparcP07214 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
SparcP07214 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SparcP07214 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SparcP07214 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SparcP07214 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SparcP07214 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SparcP07214 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SparcP07214 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms