Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BlmO88700 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BlmO88700 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BlmO88700 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BlmO88700 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BlmO88700 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BlmO88700 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BlmO88700 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BlmO88700 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BlmO88700 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BlmO88700 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms