Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClppO88696 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClppO88696 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
ClppO88696 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
ClppO88696 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
ClppO88696 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms