Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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SgceO70258 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
SgceO70258 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
SgceO70258 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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