Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Foxq1O70220 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Foxq1O70220 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms