Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Syngr1O55100 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms