Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
BckdkO55028 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
BckdkO55028 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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BckdkO55028 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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