Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E2f6O54917 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms