Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nek2O35942 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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Nek2O35942 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Nek2O35942 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Nek2O35942 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms