Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Opn1mwO35599 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Opn1mwO35599 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
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