Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smad6O35182 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms