Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm22444-201ENSMUST00000093693 108 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Olfr1135-201ENSMUST00000099853 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 1700123J17Rik-201ENSMUST00000206035 1805 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 CT573016.1-201ENSMUST00000224814 2103 ntAPPRIS P5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Gm21887J3QQ04 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr444-202ENSMUST00000204092 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC154300.1-201ENSMUST00000219735 2627 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr156-201ENSMUST00000079234 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm42611-201ENSMUST00000199446 3407 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm6116-201ENSMUST00000101121 1437 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm44667-201ENSMUST00000207632 3337 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 AC164883.2-201ENSMUST00000227931 3815 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 F930017D23Rik-201ENSMUST00000099888 1836 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Mier1-203ENSMUST00000106855 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Ccl20-202ENSMUST00000113437 794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15233-201ENSMUST00000118747 400 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Gm21887J3QQ04 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms