Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm2056J3QQ02 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms