Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Gm5225J3QPL3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Gm5225J3QPL3 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
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