Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Bbip1J3QMK2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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