Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Tmem200cJ3QK46 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms