Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm20830J3KML6 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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