Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Fxyd5-209ENSMUST00000162087 762 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Usp17ldG5E8G2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp17ldG5E8G2 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms