Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm5851-201ENSMUST00000194132 1204 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
Usp9yF8VPU6 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
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Usp9yF8VPU6 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Usp9yF8VPU6 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Usp9yF8VPU6 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Usp9yF8VPU6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
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Usp9yF8VPU6 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Usp9yF8VPU6 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
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