Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm8005F6YKY3 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm8005F6YKY3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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