Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
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Zfp988F6VKC7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Zfp988F6VKC7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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