Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Rps18-201ENSMUST00000008812 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Psmf1-202ENSMUST00000109869 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
CenpfE9Q3P4 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms