Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Myo5cE9Q1F5 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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